光合细菌和EM制剂净化技术EM菌即指有效微生物菌群，而光合细菌就是其中有代表性的菌种，此外，EM菌还包括放线菌、醋酸杆菌、乳酸杆菌、酵母菌、芽抱杆菌等菌种。光合细菌和EM制剂在我国自20世纪90年代以来，作为一种具有特殊营养、促生长、抗病因子和高效率净化养殖污水及对环境和水产动物无毒无害的特殊细菌，在水处理和动物养殖等领域中被广泛应用。张凤杰等对EM技术用于污水处理的效率进行了研究，发现同对照组相比，当水力停留时间为6h，CODcr、BOD5、NH3-N和TN的去除率分别为95.92%，99.03%，91.87%和96.77%，较对照组分别提高10.11%，8.04%，8.48%和18.41%。郑耀通利用高效菌藻系统资源化处理畜牧养殖废水。试验表明该菌藻生态系统可以使酸化养猪场污水在48h内BOD5、NH3-N的去除率分别达96.8%，98.7%，同时产生6.54g/L菌藻蛋白。目前光合细菌和微生物絮凝剂以及复合菌剂共同作用处理水产养殖污水的方法已进入实际应用阶段，而这些方法在畜禽养殖污水处理方面的应用也鲜有报道。
广东思绿环保工程有限公司人工好氧生物处理是采取人工强化供氧以提高好氧微生物活力的废水处理方法。该方法主要有活性污泥法、 生物滤池、生物转盘、生物接触氧化法、序批式活性污泥法（SBR）、厌氧/好氧（A/O）及氧化沟法等。就处理效果来讲，自动养殖污水处理，接触氧化法和生物转盘的处理效果要好于活性污泥法，虽然生物滤池的处理效果也很好，养殖污水处理设备，但易于出现滤池堵塞现象。氧化沟、SBR和A/O工艺均属于改进的活性污泥法。氧化沟出水水质好、产生泥量少，也可对污水进行脱氮处理，但其处理的BOD负荷小、占地面积大、运行费用高。SBR法自动化控制程度高，能够对污水进行深度处理，但其缺点是BOD负荷较小，韶关养殖污水处理，一次性投资也大。
A/O体是一种兼有去除BOD和脱氮双重作用的活性污泥处理工艺，养殖污水处理方案，其投资虽然偏大，但经该法处理后的水易于达标排放。因此对于那些养殖规模大、废水产生量多且有较强经济能力的养殖场可选择A/O法，而对于中等规模的养殖场可选择接触氧化和生物转盘等好氧处理工艺。
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